Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZDHHC18Q9NUE0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC18Q9NUE0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC18Q9NUE0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms