Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms