Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms