Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms