Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM3Q9NNZ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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