Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C11orf49Q9H6J7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms