Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1DQ9H5J8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms