Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 286.1 ms