Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED28Q9H204 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms