Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms