Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms