Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms