Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNPY3Q9BT09 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms