Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT17Q9BSW7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT17Q9BSW7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT17Q9BSW7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYT17Q9BSW7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYT17Q9BSW7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT17Q9BSW7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms