Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms