Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms