Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms