Protein–RNA interactions for Protein: Q96JL9

ZNF333, Zinc finger protein 333, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF333Q96JL9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF333Q96JL9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF333Q96JL9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms