Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms