Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms