Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms