Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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