Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYAP1Q96A49 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYAP1Q96A49 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms