Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOF1Q8ND07 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms