Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC197Q8NCU1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms