Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms