Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAF1Q8N7H5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAF1Q8N7H5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms