Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRAPQ7Z569 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRAPQ7Z569 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms