Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A47Q6Q0C1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A47Q6Q0C1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms