Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMBOX1Q6NT76 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMBOX1Q6NT76 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms