Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CGB2Q6NT52 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms