Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01545Q5VT33 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms