Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P3

LCE1B, Late cornified envelope protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE1BQ5T7P3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LCE1BQ5T7P3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms