Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms