Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XKR4Q5GH76 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms