Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms