Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROX2Q3B8N5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms