Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms