Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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TXNRD1Q16881 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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TXNRD1Q16881 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
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TXNRD1Q16881 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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TXNRD1Q16881 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
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TXNRD1Q16881 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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TXNRD1Q16881 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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TXNRD1Q16881 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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TXNRD1Q16881 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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TXNRD1Q16881 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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TXNRD1Q16881 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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TXNRD1Q16881 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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TXNRD1Q16881 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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