Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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CTF1Q16619 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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CTF1Q16619 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTF1Q16619 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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