Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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