Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIP13Q15645 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms