Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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TAF11Q15544 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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TAF11Q15544 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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TAF11Q15544 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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TAF11Q15544 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TAF11Q15544 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TAF11Q15544 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TAF11Q15544 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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TAF11Q15544 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF11Q15544 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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TAF11Q15544 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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