Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms