Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms