Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAPSNQ13702 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms