Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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