Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2V1Q13404 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2V1Q13404 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms