Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP140Q13342 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP140Q13342 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP140Q13342 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP140Q13342 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP140Q13342 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP140Q13342 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP140Q13342 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP140Q13342 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP140Q13342 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP140Q13342 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP140Q13342 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP140Q13342 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SP140Q13342 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SP140Q13342 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SP140Q13342 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SP140Q13342 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SP140Q13342 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SP140Q13342 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SP140Q13342 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SP140Q13342 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SP140Q13342 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SP140Q13342 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SP140Q13342 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SP140Q13342 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SP140Q13342 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SP140Q13342 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SP140Q13342 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SP140Q13342 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP140Q13342 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP140Q13342 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP140Q13342 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP140Q13342 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP140Q13342 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP140Q13342 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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SP140Q13342 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP140Q13342 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP140Q13342 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SP140Q13342 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP140Q13342 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SP140Q13342 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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