Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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